有关蛋白质结构预测问题我现在有一段蛋白质序列MTDRLVHISN NSYGTNIMRG DAGMLINYWG QWCAPCRLMAPLIEDVADQF EGRMCVARADINEDPGTAKP FGLKGIPTVI LYRNGEILASKVAAATKANL REWMEAKLG1、请问用什么网上的软件预测此序列二级结构比较
来源:学生作业学帮网 编辑:学帮网 时间:2024/06/05 22:50:31
有关蛋白质结构预测问题
我现在有一段蛋白质序列
MTDRLVHISN NSYGTNIMRG DAGMLINYWG QWCAPCRLMAPLIEDVADQF EGRMCVARAD
INEDPGTAKP FGLKGIPTVI LYRNGEILASKVAAATKANL REWMEAKLG
1、请问用什么网上的软件预测此序列二级结构比较好?
2、如何预测此序列三级结构并构图?
3、如何去评估这预测三级结构的质量?
4、What is the distance (in Angstroms) between:
a) the CA atom of residue 42 and the CB atom of residue 45?
b) the N atom of residue 1 and the C atom ofresidue 109?
5、Residues 80-90 的 phi/psi torsion angles 是多少?
6、在PDB数据库里面哪个蛋白质的结构跟题目蛋白质的结构最像?
7、这个蛋白质的名字或功能可能是什么?
你问的问题太多了.这是一个复杂的工程,你还是自己慢慢摸索,基本上我摸索就是通过自己看文献和在EXPASY网上自己看的,http://www.expasy.org/tools/#ptm.
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